Formation en bioinformatique pour l’analyse des données de séquençage NGS à l’Institut Pasteur
Formation en bioinformatique pour l’analyse des données de séquençage NGS à l’Institut Pasteur
© Sarah Michel-Anfray – Institut Pasteur
Du 3 au 7 juin 2024, l’Institut Pasteur a accueilli 14 bioinformaticiens et biologistes travaillant sur l’analyse de données de séquençage de nouvelle génération (NGS) provenant des sept membres du Pasteur Network et du réseau AFROSCREEN : le Centre Pasteur Cameroun, le CERMES Niger, l’Institut Pasteur de Bangui, l’Institut Pasteur de Côte d’Ivoire, l’Institut Pasteur de Dakar, l’Institut Pasteur de Guinée et l’Institut Pasteur de Madagascar.
L’objectif de cette semaine de cours était de former les participants à l’analyse des données de séquençage NGS du SARS-CoV-2 avec la technologie MinION d’Oxford Nanopore Technologies, couvrant le processus complet depuis les données brutes jusqu’à l’obtention de séquences consensus.
Conçues et animées conjointement par l’Unité de recherche et d’expertise Environnement et Risques Infectieux (ERI) de la Cellule d’Intervention Biologique d’Urgence (CIBU), le Hub de Bioinformatique et Biostatistique, la plateforme technologique Biomics, la plateforme Infrastructure et Ingénierie scientifique de l’Institut Pasteur (Paris), ainsi que le groupe Surveillance Génomique du Pôle Epidémiologie, Recherche clinique et Science des données de l’Institut Pasteur de Dakar, les sessions ont pu offrir un environnement d’apprentissage interactif et intensif.
Ces cinq jours d’échanges dynamiques ont non seulement renforcé les compétences techniques du groupe de bioinformaticiens, mais aussi consolidé l’esprit collaboratif au sein du Pasteur Network contribuant ainsi à l’avancement continu du projet AFROSCREEN.
© Sarah Michel-Anfray – Institut Pasteur
Du 3 au 7 juin 2024, l’Institut Pasteur a accueilli 14 bioinformaticiens et biologistes travaillant sur l’analyse de données de séquençage de nouvelle génération (NGS) provenant des sept membres du Pasteur Network et du réseau AFROSCREEN : le Centre Pasteur Cameroun, le CERMES Niger, l’Institut Pasteur de Bangui, l’Institut Pasteur de Côte d’Ivoire, l’Institut Pasteur de Dakar, l’Institut Pasteur de Guinée et l’Institut Pasteur de Madagascar.
L’objectif de cette semaine de cours était de former les participants à l’analyse des données de séquençage NGS du SARS-CoV-2 avec la technologie MinION d’Oxford Nanopore Technologies, couvrant le processus complet depuis les données brutes jusqu’à l’obtention de séquences consensus.
Conçues et animées conjointement par l’Unité de recherche et d’expertise Environnement et Risques Infectieux (ERI) de la Cellule d’Intervention Biologique d’Urgence (CIBU), le Hub de Bioinformatique et Biostatistique, la plateforme technologique Biomics, la plateforme Infrastructure et Ingénierie scientifique de l’Institut Pasteur (Paris), ainsi que le groupe Surveillance Génomique du Pôle Epidémiologie, Recherche clinique et Science des données de l’Institut Pasteur de Dakar, les sessions ont pu offrir un environnement d’apprentissage interactif et intensif.
Ces cinq jours d’échanges dynamiques ont non seulement renforcé les compétences techniques du groupe de bioinformaticiens, mais aussi consolidé l’esprit collaboratif au sein du Pasteur Network contribuant ainsi à l’avancement continu du projet AFROSCREEN.